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新たな仲間「ヤッターペリカン」は、ガンちゃんたちがヤッターワンの修理にかかりきりになっているのを見て不満を抱き、勝手にパトロールへ出かけてしまう。早くも仲間割れか!? そんな中、ドクロリングは横浜の高層ビルのてっぺんにあると判明。ドロンボー一味に騙されたペリカンは、ドクロリング探しに協力してしまう…。